Institute record of Bioinformatics and (eco-)systems biology lab

Information

Type
Organization
Type
https://marineinfo.org/ns/institutes/types#Scientific
Name
Bioinformatics and (eco-)systems biology lab
Name
Laboratorium voor Bioinformatica en Ecosysteembiology@nl
Acronym
KULeuven
Parent institute
KU Leuven; Rega-instituut; Department of Microbiology and Immunology
Address
Herestraat 49, box 1028, B-3000 Leuven, Belgium
Location
latitude
50.8825757
longitude
4.6745014
Description @en
The Raes lab combines large-scale, next-generation sequencing with novel computational approaches to investigate the functioning and variability of microbial communities. In addition, the lab focuses on the development of computational methods for the analysis of (next-generation) sequence data and the investigation of community properties from metagenomics, metatranscriptomics and meta-metabolomics data, which are applied in a wide range of environments (ocean, soil, etc.). The marine research of the lab focuses on comparative metagenomics and metatranscriptomics of ocean plankton communities, from viruses to fish larvae. This research is also part of the Bioinformatics and (Eco-)systems Biology lab of VIB.
Description @nl
Het Raes lab combineert grootschalige next-generation sequencing met nieuwe computationele benaderingen om het functioneren en de variabiliteit van microbiële gemeenschappen te onderzoeken. Daarnaast richt het lab zich op het ontwikkelen van computationele methodes voor de analyse van (next-generation) sequence data en het onderzoek van eigenschappen van gemeenschappen aan de hand van metagenomica, transcriptoomstudie en meta-metabolomics data, die vervolgens toegepast worden in verschillende omgevingen (oceanen, bodem, etc.). Het marien onderzoek van het lab richt zich op vergelijkende metagenomica en de transcriptoomstudie van oceanische planktongemeenschappen gaande van virussen tot larven van vissen. Dit onderzoek maakt eveneens deel uit van het Laboratorium voor Bioinformatica en Ecosysteembiologie van het VIB.

Members

Jeroen Raes
role: Group Leader
Samuel Chaffron
role: Post-doctoral scientist
Youssef El Darzi
role: Ph.D. Student
Karoline Faust
role: Post-doctoral scientist
Gipsi Lima Mendez
role: Post-doctoral scientist
Sara Vieira-Silva
role: Post-doctoral scientist
Jun Wang

Past members

Fabrizio Carcillo
role: Ph.D. Student

Special collections

Marine expertise
Marine expertise: Type: Flemish university

record metadata

date created: 2015-07-13
date modified: 2015-07-13