Institute record of Service d'Écologie Numérique des Milieux Aquatiques

Information

Type
Organization
Type
https://marineinfo.org/ns/institutes/types#Scientific
Name
Service d'Écologie Numérique des Milieux Aquatiques
Name
Numerical Ecology and Aquatic Systems group@en
Acronym
Umons
Parent institute
Université de Mons; Faculté des Sciences; Département de Biologie
Address
Avenue du champ de Mars 6, Bâtiment Pentagone, 7000 Mons, Belgium
Contact numbers
Telephone
+32-(0)6-537 34 97
Email
philippe.grosjean@umons.ac.be
Location
latitude
50.4626827
longitude
3.9529666
Description @en
The Numerical Ecology unit studies marine plankton using digital imaging techniques combined with automated and semi-automated machine learning classification. The research focus is on the adaptation potential of these animals to environmental changes (temperature, acidification and eutrophication). Furthermore, the research group also develops scientific software, which is called Zoo/PhytoImage, for the elaboration of spatio-temporal plankton series by automating the sample processing. This open-source software allows to analyse various kinds of digital images of plankton, and to measure, count and classify the different planktonic organisms digitally fixed on these images. It then calculates ecologically important variables, such as abundances, biomasses and size spectra by taxonomic group or for the whole sample. Also other extensions to R software are developed, such as SciViews for a homogenisation of its user interface, pastecs for the analysis of spatio-temporal series in ecology, aurelhy for the spatial interpolation of hydro-climatic variables, or the generation of graphs to be directly used for publication.
Description @nl
De onderzoeksgroep Écologie Numérique bestudeert mariene plankton met behulp van digitale beeldvormingstechnieken in combinatie met geautomatiseerde en semi-geautomatiseerde machine-learning classificatie. Het onderzoek richt zich op het aanpassingsvermogen van deze dieren aan veranderingen in het milieu (temperatuur, verzuring en eutrofiëring). Daarnaast ontwikkelt de onderzoeksgroep ook wetenschappelijke software, genaamd Zoo/PhytoImage, voor de uitwerking van ruimtelijk-temporele plankton reeksen door de staalverwerking te automatiseren. Deze open-source software maakt het mogelijk verschillende soorten digitale beelden van plankton te analyseren, en de verschillende planktonische organismen digitaal op deze beelden te meten, te tellen en te classificeren. Vervolgens berekent het ecologisch belangrijke variabelen, zoals abundanties, biomassa's en groottespectra per taxonomische groep of voor het gehele staal. Ook andere uitbreidingen op R-software worden ontwikkeld, zoals SciViews voor een homogenisering van de gebruikersinterface, pastecs voor de analyse van spatio-temporele reeksen in de ecologie, aurelhy voor de ruimtelijke interpolatie van hydro-klimaatvariabelen, of het genereren van grafieken die rechtstreeks voor publicatie kunnen worden gebruikt.

Members

Philippe Grosjean
Guyliann Engels

Past members

Aitor Albaina
Nour Ali
Antoine Antoine Antoine Antoine Batigny
Kevin Denis
Julien Leblud
Laure Moulin
Yamina Rouabhi
Narjisse Tabout
Guillaume Wacquet

Expertise

Biodiversity
defined term set: MOG Topics
term code: 181484
Climate change
defined term set: MOG Topics
term code: 181490
Microbiology
defined term set: MOG Topics
term code: 181509

Special collections

Marine expertise
Marine expertise: Type: French speaking university

record metadata

date created: 2007-06-21
date modified: 2013-10-24