Project record of Meta-transcriptomics of plankton in the Belgian Part of the North Sea

Information

Type
Project
Name
Meta-transcriptomics of plankton in the Belgian Part of the North Sea
Description @en
Natural ecosystems are often too complex to study them under controlled laboratory conditions. Organisms interact with their environment in multifaceted ways. Our understanding of how species traits, species interactions and evolution of individual species contribute to ecosystem functions is therefore still very fragmentary. Nevertheless, we urgently need better insights in the functioning of ecosystems to predict how they will change under anthropogenic pressures such as global warming or ocean acidification. In this research line, VLIZ aims to unravel important processes in natural plankton communities such as ecosystem functions, and mutualist and antagonistic interactions among different species using an ecosystems biology approach. Specifically, VLIZ wants to use high throughput sequencing to describe the composition (metagenomics) and functions (meta-transcriptomics) of plankton communities. This information will be used to model relevant ecosystem processes such as biogeochemical cycling. VLIZ is furthermore interested to investigate how such processes will alter under various scenarios of global change. The study area is primarily the southern North Sea, where field surveys can readily be conducted to cover seasonal and spatial dynamics of plankton communities.
Description @nl
Natuurlijke ecosystemen zijn vaak te complex om ze onder gecontroleerde laboratoriumomstandigheden te bestuderen. Organismen interageren op verschillende manieren met hun omgeving. Ons begrip van hoe soortenkenmerken, soorteninteracties en de evolutie van individuele soorten bijdragen aan ecosysteemfuncties is daarom nog steeds zeer fragmentarisch. Desondanks hebben we noodzaak aan betere inzichten in het functioneren van ecosystemen om te voorspellen hoe deze zullen veranderen onder antropogene druk zoals opwarming van de aarde of verzuring van de oceaan. In deze onderzoekslijn wil VLIZ belangrijke processen in natuurlijke planktongemeenschappen zoals ecosysteemfuncties en mutualistische en antagonistische interacties tussen verschillende soorten ontrafelen met behulp van een ecosysteembiologische benadering. VLIZ wil met name high throughput-sequencing gebruiken om de samenstelling (metagenomics) en functies (meta-transcriptomics) van planktongemeenschappen te beschrijven. Deze informatie zal worden gebruikt om relevante ecosysteemprocessen zoals biogeochemical cycling te modelleren. VLIZ is verder geïnteresseerd om te onderzoeken hoe dergelijke processen zullen veranderen in verschillende scenario's van wereldwijde verandering. Het studiegebied is voornamelijk de zuidelijke Noordzee, waar veldonderzoeken gemakkelijk kunnen worden uitgevoerd om de seizoensgebonden en ruimtelijke dynamiek van planktongemeenschappen te ontsluiten.
Start date
2020-1
End date
2024-12

Institutes & people involved

Hablützel Pascal
associated with: Vlaams Instituut voor de Zee
Interuniversitair Micro-Elektronica Centrum
role: Partner
Flanders Institute for Biotechnology
role: Partner
Universiteit Gent
role: Partner

record metadata

date created: 2020-06-19
date modified: 2025-01-01