Project record of Genomic adaptation in the marine goby Pomatoschistus minutus

Information

Type

Project

Name

Genomic adaptation in the marine goby Pomatoschistus minutus

Name @nl

De genomica van lokale adaptatie bij een mariene demersale vis

Description @en

This project aims at understanding the relation between neutral population structure and local adaptation in a marine fish. This is done by studying the interaction between selection, population history, gene flow and genetic drift. To study adaptation of a species a sound knowledge on the spatio/temporal genetic structure is a prerequisite. The relative importance of genetic drift and gene flow in the sand goby will be estimated from a spatio-temporal population genetic analysis with various kinds of neutral genetic markers. Only than is it feasible to show and quantify local adaptation over an ecological gradient and to link the distribution of adaptive variation with neutral structure. In this way the relative importance of adaptation can be estimated and partially explained. This will be done with indirect methods, outlier loci (genome screening) and possible indications of selection (candidate gene analysis).

Description @nl

Dit project heeft als doel een inzicht te verwerven in de relatie tussen de neutrale populatiestructuur en lokale adaptatie bij een mariene vissoort. Dit gebeurt door de interactie te bestuderen tussen selectie, populatiegeschiede-nis, genmigratie en genetische drift. Om adaptatie binnen een soort te bestuderen is allereerst een grondige kennis van de spatio/temporele genetische structuur vereist. Het relatief belang van genetische drift en migratie bij het dikkopje zal worden ingeschat op basis van een spatio-temporele populatiegenetische analyse met behulp van verschillende types neutrale genetische merkers. Daarna is het mogelijk om lokale adaptatie aan te tonen en te kwantificeren over een ecologische gradiënt en om de distributie van adaptieve variatie te koppelen aan de neutrale structuur. Op die manier zal het relatief belang van adaptatie ingeschat en deels verklaard worden. Dit zal gerealiseerd worden op basis van indirecte methodes, uitschieterloci (genoomscreening) en mogelijke afdrukken van selectie (kandidaatgenanalyse).

Start date

2005-10

End date

2007-9