Project record of Genomic variation in European sea bass: from SNP discovery within ESTs to genome scan

Information

Type

Project

Name

Genomic variation in European sea bass: from SNP discovery within ESTs to genome scan

Name @nl

Genomische variatie in de zeebaars: van SNP ontdekking in ESTs tot een genoomscan

Description @en

Overall aim is to identify genes which are associated with selection in wild populations of European sea bass. Therefore a data bank of 30,000 Expressed Sequence Tags of European sea bass is screened for Single Nucleotide Polymorphisms with bioinformatic methods. The potential markers are validated in the lab. A North Sea and Mediterranean Sea population will be tested for neutral and adaptive evolution based on a genome scan.

Description @nl

Algemeen doel is de identificatie van genen die geassocieerd zijn met selectie in wilde populaties van zeebaars. Daartoe wordt in een databank van 30,000 Expressed Sequence Tags van zeebaars gezocht naar Single Nucleotide Polymorfismen met bioinformatische methodes. De potentiële merkers worden gevalideerd in het laboratorium. Vervolgens zullen een Noordzee en Middellandse Zee populatie getoetst worden voor neutrale en adaptieve evolutie op basis van een genoomscan.

Start date

2004-10

End date

2008-10