COOL BLUE: Biodiversity survey of low-trophic aquaculture sites in Sweden and Denmark using eDNA and video monitoring
Citation
Dalipi X, Heitzmann M, Rosengren M, Obst M, Panova M (2026). COOL BLUE: Biodiversity survey of low-trophic aquaculture sites in Sweden and Denmark using eDNA and video monitoring. Version 1.0. Samplingevent dataset. https://www.gbif.se/ipt/resource?r=coolblue_dataset&v=1.0. https://marineinfo.org/doc/dataset/9203
Contact:
Panova, Marina ;
Obst, Matthias Availability:
 This dataset is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.Description
This dataset provides species occurrence records from a biodiversity survey of low-trophic aquaculture sites cultivating blue mussels (Mytilus edulis), carried out within the COOL BLUE project. Records were obtained using two complementary monitoring approaches: eDNA metabarcoding, based on water samples and Autonomous Reef Monitoring Structures (ARMS) bulk samples, and baited remote underwater video (BRUV). For the BRUV approach, the associated video data were also used to train a machine learning model to identify the recorded taxa. Further information on the methodology and procedure is available here. Scope Keywords: Marine/Coastal · Aquaculture · Swedish part of the Kattegat · Acartiidae Sars G.O., 1903 · Amphipoda · Anguillidae Rafinesque, 1810 · Anguilliformes · Animalia · Annelida · Anthoathecata · Aoridae Stebbing, 1899 · Aphroditidae Malmgren, 1867 · Arenicolidae Johnston, 1835 · Arthropoda · Ascidiacea · Asteriidae Gray, 1840 · Asteroidea · Balanidae Leach, 1817 · Balanomorpha · Belonidae Bonaparte, 1835 · Beloniformes · Bivalvia · Bolinopsidae Bigelow, 1912 · Branchiopoda · Bryozoa · Calanoida · Campanulariidae Johnston, 1836 · Carangidae Rafinesque, 1815 · Cardiidae Lamarck, 1809 · Caryophylliidae Dana, 1846 · Centropagidae Giesbrecht, 1893 · Cephalotrichidae McIntosh, 1874 · Cheilostomatida · Chironomidae · Chordata · Chromadorea · Chromadorida · Chromadoridae Filipjev, 1917 · Cionidae Lahille, 1887 · Clausocalanidae Giesbrecht, 1893 · Clitellata · Clupeiformes · Cnidaria · Copepoda · Corophiidae Leach, 1814 · Corymorphidae Allman, 1872 · Corynidae Johnston, 1836 · Cottidae Bonaparte, 1831 · Crangonidae Haworth, 1825 · Ctenophora · Ctenostomatida · Cyclopoida · Cyclopteridae Bonaparte, 1831 · Cyprinidae Rafinesque, 1815 · Cypriniformes · Decapoda · Demospongiae · Diptera · Echinodermata · Echinoidea · Emplectonematidae Bürger, 1904 · Engraulidae Gill, 1861 · Flosculariaceae · Flustridae Fleming, 1828 · Forcipulatida · Gadidae Rafinesque, 1810 · Gadiformes · Gammaridae Latreille, 1802 · Gasterosteidae Bonaparte, 1831 · Gastropoda · Gobiidae Cuvier, 1816 · Gymnolaemata · Halichondriidae Gray, 1867 · Hesionidae Grube, 1850 · Hexacorallia · Hexapoda · Hoplonemertea · Hydractiniidae L. Agassiz, 1862 · Hydrobiidae W. Stimpson, 1865 · Hydrozoa · Idoteidae Samouelle, 1819 · Ischyroceridae Stebbing, 1899 · Isopoda · Janiridae G. O. Sars, 1897 · Labridae Cuvier, 1816 · Leptothecata · Liparidae Gill, 1861 · Littorinidae Children, 1834 · Littorinimorpha · Lobata · Lophiidae Rafinesque, 1810 · Lophiiformes · Lotidae Bonaparte, 1835 · Loveniidae Lambert, 1905 · Mactridae Lamarck, 1809 · Magelonidae Cunningham & Ramage, 1888 · Malacostraca · Melitidae Bousfield, 1973 · Mollusca · Monostilifera · Myidae Lamarck, 1809 · Mytilicolidae Bocquet & Stock, 1957 · Mytilida · Mytilidae Rafinesque, 1815 · Naididae Ehrenberg, 1831 · Nematoda · Nemertea · Nereididae Blainville, 1818 · Ophiotomidae Paterson, 1985 · Ophiuroidea · Orbiniidae Hartman, 1942 · Oregoniidae Garth, 1958 · Paguridae Latreille, 1802 · Palaemonidae Rafinesque, 1815 · Palaeonemertea · Pandeidae Haeckel, 1879 · Panopeidae Ortmann, 1893 · Paracalanidae Giesbrecht, 1893 · Pectinariidae Quatrefages, 1866 · Percidae Rafinesque, 1815 · Perciformes · Phlebobranchia · Pholidae Gill, 1893 · Phyllodocida · Phyllodocidae Örsted, 1843 · Pleuronectidae Rafinesque, 1815 · Pleuronectiformes · Podonidae Mordukhai-Boltovskoi, 1968 · Polychaeta · Polynoidae Kinberg, 1856 · Porifera · Rathkeidae Russell, 1953 · Rissoidae J. E. Gray, 1847 · Rotifera · Salmonidae Cuvier, 1816 · Salmoniformes · Scleractinia · Scophthalmidae Chabanaud, 1933 · Scyphozoa · Soleidae Bonaparte, 1833 · Spatangoida · Spionida · Spionidae Grube, 1850 · Suberitida · Suberitidae Schmidt, 1870 · Syngnathidae Bonaparte, 1831 · Syngnathiformes · Teleostei · Tellinidae Blainville, 1814 · Temoridae Giesbrecht, 1893 · Tentaculata · Terebellida · Terebellidae Johnston, 1846 · Testudinellidae Harring, 1913 · Thecostraca · Trachinidae Rafinesque, 1815 · Ulmaridae Haeckel, 1880 · Venerida · Veneridae Rafinesque, 1815 · Vesiculariidae Johnston, 1838 Geographical coverage Swedish part of the Kattegat [Marine Regions] Temporal coverage
7 November 2023 - 26 July 2024 Taxonomic coverage
Acartiidae Sars G.O., 1903 [WoRMS]
Amphipoda [WoRMS]
Anguillidae Rafinesque, 1810 [WoRMS]
Anguilliformes [WoRMS]
Animalia [WoRMS]
Annelida [WoRMS]
Anthoathecata [WoRMS]
Aoridae Stebbing, 1899 [WoRMS]
Aphroditidae Malmgren, 1867 [WoRMS]
Arenicolidae Johnston, 1835 [WoRMS]
Arthropoda [WoRMS]
Ascidiacea [WoRMS]
Asteriidae Gray, 1840 [WoRMS]
Asteroidea [WoRMS]
Balanidae Leach, 1817 [WoRMS]
Balanomorpha [WoRMS]
Belonidae Bonaparte, 1835 [WoRMS]
Beloniformes [WoRMS]
Bivalvia [WoRMS]
Bolinopsidae Bigelow, 1912 [WoRMS]
Branchiopoda [WoRMS]
Bryozoa [WoRMS]
Calanoida [WoRMS]
Campanulariidae Johnston, 1836 [WoRMS]
Carangidae Rafinesque, 1815 [WoRMS]
Cardiidae Lamarck, 1809 [WoRMS]
Caryophylliidae Dana, 1846 [WoRMS]
Centropagidae Giesbrecht, 1893 [WoRMS]
Cephalotrichidae McIntosh, 1874 [WoRMS]
Cheilostomatida [WoRMS]
Chironomidae [WoRMS]
Chordata [WoRMS]
Chromadorea [WoRMS]
Chromadorida [WoRMS]
Chromadoridae Filipjev, 1917 [WoRMS]
Cionidae Lahille, 1887 [WoRMS]
Clausocalanidae Giesbrecht, 1893 [WoRMS]
Clitellata [WoRMS]
Clupeiformes [WoRMS]
Cnidaria [WoRMS]
Copepoda [WoRMS]
Corophiidae Leach, 1814 [WoRMS]
Corymorphidae Allman, 1872 [WoRMS]
Corynidae Johnston, 1836 [WoRMS]
Cottidae Bonaparte, 1831 [WoRMS]
Crangonidae Haworth, 1825 [WoRMS]
Ctenophora [WoRMS]
Ctenostomatida [WoRMS]
Cyclopoida [WoRMS]
Cyclopteridae Bonaparte, 1831 [WoRMS]
Cyprinidae Rafinesque, 1815 [WoRMS]
Cypriniformes [WoRMS]
Decapoda [WoRMS]
Demospongiae [WoRMS]
Diptera [WoRMS]
Echinodermata [WoRMS]
Echinoidea [WoRMS]
Emplectonematidae Bürger, 1904 [WoRMS]
Engraulidae Gill, 1861 [WoRMS]
Flosculariaceae [WoRMS]
Flustridae Fleming, 1828 [WoRMS]
Forcipulatida [WoRMS]
Gadidae Rafinesque, 1810 [WoRMS]
Gadiformes [WoRMS]
Gammaridae Latreille, 1802 [WoRMS]
Gasterosteidae Bonaparte, 1831 [WoRMS]
Gastropoda [WoRMS]
Gobiidae Cuvier, 1816 [WoRMS]
Gymnolaemata [WoRMS]
Halichondriidae Gray, 1867 [WoRMS]
Hesionidae Grube, 1850 [WoRMS]
Hexacorallia [WoRMS]
Hexapoda [WoRMS]
Hoplonemertea [WoRMS]
Hydractiniidae L. Agassiz, 1862 [WoRMS]
Hydrobiidae W. Stimpson, 1865 [WoRMS]
Hydrozoa [WoRMS]
Idoteidae Samouelle, 1819 [WoRMS]
Ischyroceridae Stebbing, 1899 [WoRMS]
Isopoda [WoRMS]
Janiridae G. O. Sars, 1897 [WoRMS]
Labridae Cuvier, 1816 [WoRMS]
Leptothecata [WoRMS]
Liparidae Gill, 1861 [WoRMS]
Littorinidae Children, 1834 [WoRMS]
Littorinimorpha [WoRMS]
Lobata [WoRMS]
Lophiidae Rafinesque, 1810 [WoRMS]
Lophiiformes [WoRMS]
Lotidae Bonaparte, 1835 [WoRMS]
Loveniidae Lambert, 1905 [WoRMS]
Mactridae Lamarck, 1809 [WoRMS]
Magelonidae Cunningham & Ramage, 1888 [WoRMS]
Malacostraca [WoRMS]
Melitidae Bousfield, 1973 [WoRMS]
Mollusca [WoRMS]
Monostilifera [WoRMS]
Myidae Lamarck, 1809 [WoRMS]
Mytilicolidae Bocquet & Stock, 1957 [WoRMS]
Mytilida [WoRMS]
Mytilidae Rafinesque, 1815 [WoRMS]
Naididae Ehrenberg, 1831 [WoRMS]
Nematoda [WoRMS]
Nemertea [WoRMS]
Nereididae Blainville, 1818 [WoRMS]
Ophiotomidae Paterson, 1985 [WoRMS]
Ophiuroidea [WoRMS]
Orbiniidae Hartman, 1942 [WoRMS]
Oregoniidae Garth, 1958 [WoRMS]
Paguridae Latreille, 1802 [WoRMS]
Palaemonidae Rafinesque, 1815 [WoRMS]
Palaeonemertea [WoRMS]
Pandeidae Haeckel, 1879 [WoRMS]
Panopeidae Ortmann, 1893 [WoRMS]
Paracalanidae Giesbrecht, 1893 [WoRMS]
Pectinariidae Quatrefages, 1866 [WoRMS]
Percidae Rafinesque, 1815 [WoRMS]
Perciformes [WoRMS]
Phlebobranchia [WoRMS]
Pholidae Gill, 1893 [WoRMS]
Phyllodocida [WoRMS]
Phyllodocidae Örsted, 1843 [WoRMS]
Pleuronectidae Rafinesque, 1815 [WoRMS]
Pleuronectiformes [WoRMS]
Podonidae Mordukhai-Boltovskoi, 1968 [WoRMS]
Polychaeta [WoRMS]
Polynoidae Kinberg, 1856 [WoRMS]
Porifera [WoRMS]
Rathkeidae Russell, 1953 [WoRMS]
Rissoidae J. E. Gray, 1847 [WoRMS]
Rotifera [WoRMS]
Salmonidae Cuvier, 1816 [WoRMS]
Salmoniformes [WoRMS]
Scleractinia [WoRMS]
Scophthalmidae Chabanaud, 1933 [WoRMS]
Scyphozoa [WoRMS]
Soleidae Bonaparte, 1833 [WoRMS]
Spatangoida [WoRMS]
Spionida [WoRMS]
Spionidae Grube, 1850 [WoRMS]
Suberitida [WoRMS]
Suberitidae Schmidt, 1870 [WoRMS]
Syngnathidae Bonaparte, 1831 [WoRMS]
Syngnathiformes [WoRMS]
Teleostei [WoRMS]
Tellinidae Blainville, 1814 [WoRMS]
Temoridae Giesbrecht, 1893 [WoRMS]
Tentaculata [WoRMS]
Terebellida [WoRMS]
Terebellidae Johnston, 1846 [WoRMS]
Testudinellidae Harring, 1913 [WoRMS]
Thecostraca [WoRMS]
Trachinidae Rafinesque, 1815 [WoRMS]
Ulmaridae Haeckel, 1880 [WoRMS]
Venerida [WoRMS]
Veneridae Rafinesque, 1815 [WoRMS]
Vesiculariidae Johnston, 1838 [WoRMS]
Release date: 2026-09-09
Metadatarecord created: 2026-09-10
Information last updated: 2026-09-10
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